23例での報告では、WMTは58回中5.2%の軽微な有害事象で耐容性良好とされ、SCORAD・EASI・DLQI・掻痒スコアが有意に改善した。好塩基球は減少し他の血液学的指標やサイトカインは概ね安定。腸ではMicrobiome Health Index改善と短鎖脂肪酸産生菌の増加、皮膚ではブドウ球菌優位からAcinetobacterやPerlucidibaca等の増加へ変化し、これらの微生物変化は臨床重症度や全身炎症と逆相関した。

軽〜中等度小児ADは腸内微生物の多様性増加と組成変化（Bacteroidota↑、Actinomycetota↓、Bifidobacterium↓、特定Bacteroides種↑）および脂質・核酸代謝の変動が観察された。複合バイオマーカーは探索的に高い診断性能を示したが、単施設・横断研究のため因果は不明で外部検証が必要。

23例での報告では、WMTは58回中5.2%の軽微な有害事象で耐容性良好とされ、SCORAD・EASI・DLQI・掻痒スコアが有意に改善した。好塩基球は減少し他の血液学的指標やサイトカインは概ね安定。腸ではMicrobiome Health Index改善と短鎖脂肪酸産生菌の増加、皮膚ではブドウ球菌優位からAcinetobacterやPerlucidibaca等の増加へ変化し、これらの微生物変化は臨床重症度や全身炎症と逆相関した。

腸内微生物叢の乱れが皮膚微生物叢を変化させ、黄色ブドウ球菌などの優勢化を招き得ることが示唆される。免疫応答の変化と結びつき、AD発症に関与する可能性があるため、プレ／プロバイオティクスが予防・治療の候補となるが、因果関係や臨床効果の確証にはさらなる研究が必要。

BP患者は腸内細菌のα多様性が低下し全体的に構成が変化。Faecalibacterium prausnitziiの減少とGABA代謝関連経路の増加が観察され、腸内細菌の変化がBPと関連し得ることを示唆するが因果関係は示されず機序の実証が必要。

皮膚と腸の微生物に関する遺伝的素因が皮膚付属器疾患（SADs）と双方向の因果関係を示唆した。皮膚微生物では65件、腸微生物では161件の関連を検出し、それぞれ5件と11件がボンフェローニ補正で有意とされた。表皮のStaphylococcusやStreptococcus、Propionibacteriumは複数のSADsと関連し、BifidobacteriaやLactobacilliは保護的と報告された。感受性解析で有意な異質性や水平的多面性は検出されなかったが、詳細な効果量や一般化可能性は明示されていない。

オレイン酸誘導ニキビマウスで、生菌CCFM8661は皮膚炎や血清中のインスリン・テストステロンを低下させ、皮膚の中性脂肪や遊離脂肪酸を減らし脂質代謝関連遺伝子発現を正常化した。死菌は炎症やホルモンには影響せず一部の脂質と遺伝子発現を改善した。両者は腸内細菌多様性を高め、Bacteroidetes/Firmicutes比と糞便中Staphylococcusを低下させ、腸内環境改善が関与する可能性が示唆された。結果はマウスモデルに基づく。

B. longum CCFM1029はトリプトファン代謝を高め、インドール系代謝物I3Cを増やしてAHR経路を活性化し、Th2過剰反応を抑えてAD症状を改善したと報告。AHR阻害薬で効果は消失し、便・血中I3C増加やLachnospiraceaeの維持も観察された。ただし臨床の詳細や規模は示されていない。

投薬前のAD患者は腸内に多様性や組成の乱れ（F/B比上昇、ビフィズス菌減少など）が見られ、デュピルマブ16週投与でβ多様性や菌群構造が改善し、ビフィズス菌やRuminococcus gnavus、Coprococcusが増加。トリプトファンのインドール経路関連遺伝子発現と代謝物も増加を示した。変化は症状改善の程度とは大部分独立であり、観察研究のため因果関係は未確定。

Qing‑Re‑Qu‑Shi群は12週でEASIなどの臨床指標と患者報告アウトカムが有意に改善し、EASI-50/75も多かった。腸内はShannon多様性はほぼ変わらなかったがβ多様性に小さな群×時間効果があり、BlautiaやBifidobacteriumなどが増え、Escherichia/Shigellaらが減少。血清では短鎖脂肪酸・インドール関連シグナル増、キヌレニン関連低下が観察され、これら変化は症状改善と関連していたが因果関係は示されない。