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Porphyromonas gingivalisの代謝
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Metabolic pathways for cytotoxic end product formation from glutamate- and aspartate-containing peptides by Porphyromonas gingivalis.
PMID
10940008
スタディーの内容
P. gingivalisの洗浄細胞がグルタミン酸・アスパラギン酸含有ペプチドを代謝し、毒性末端産物を形成する代謝経路を検討した
アブストの内容
洗浄細胞は単独アミノ酸を使わずペプチドを利用。Glu-Gluは酪酸・プロピオン酸・酢酸・アンモニア、Asp-Aspは酪酸・コハク酸・酢酸・アンモニアを生成した。酵素検出と炭素収支から、ジペプチドはジペプチダーゼで加水分解され、脱アミノ化や酸化／還元反応を経てスクシニル-CoAやアセチル-CoAに至り、最終的に酪酸・プロピオン酸・酢酸が生じるという代謝経路が提案された（in vitro、提案段階）。
選ばれた理由
論文はPorphyromonas gingivalisがアミノ酸とペプチドの分解を介してアンモニアを生成し、これが細胞周囲のpH値や微生物環境に影響を与えるという仮説を直接支持しています。
関係する細菌（属レベル）
関係する細菌（種レベル）
porphyromonas
porphyromonas gingivalis
Acid tolerance and acid-neutralizing activity of Porphyromonas gingivalis, Prevotella intermedia and Fusobacterium nucleatum.
PMID
9573805
スタディーの内容
P. gingivalis、P. intermedia、F. nucleatumの酸耐性と酸を中和する能力を培養系で比較検討した。
アブストの内容
P. gingivalisは中性条件でのみ増殖し糖を利用せず培養中にpHを上げる傾向だった。P. intermediaとF. nucleatumは酸性下でも増殖でき、糖存在下ではpHを下げ、糖欠乏下ではpHを上げた。休止細胞とpH-stat解析で、アミノ酸の脱アミノ化に伴いアンモニアと菌種特異的な有機酸（P. gingivalis: ブチル酸・イソブチル酸・イソ吉草酸、P. intermedia: イソ吉草酸・コハク酸、F. nucleatum: プロピオン酸・ブチル酸）を産生し、酸中和が起きることが示された。これらは歯垢内での分布差やP. gingivalisの生息制限を部分的に説明する可能性がある。
選ばれた理由
論文のアブストラクトは、Porphyromonas gingivalisがアミノ酸のデアミナーゼ作用とプロテオイドペプチドの分解によりアンモニアを生成し、これによってpHが変化すると述べています。
関係する細菌（属レベル）
関係する細菌（種レベル）
fusobacterium, porphyromonas, prevotella
fusobacterium nucleatum, porphyromonas gingivalis, prevotella intermedia
Metabolic pathways for cytotoxic end product formation from glutamate- and aspartate-containing peptides by Porphyromonas gingivalis.
PMID
10940008
スタディーの内容
P. gingivalisの洗浄細胞がグルタミン酸・アスパラギン酸含有ペプチドを代謝し、毒性末端産物を形成する代謝経路を検討した
アブストの内容
洗浄細胞は単独 アミノ酸を使わずペプチドを利用。Glu-Gluは酪酸・プロピオン酸・酢酸・アンモニア、Asp-Aspは酪酸・コハク酸・酢酸・アンモニアを生成した。酵素検出と炭素収支から、ジペプチドはジペプチダーゼで加水分解され、脱アミノ化や酸化／還元反応を経てスクシニル-CoAやアセチル-CoAに至り、最終的に酪酸・プロピオン酸・酢酸が生じるという代謝経路が提案された（in vitro、提案段階）。
選ばれた理由
論文のアブストラクトは、P. gingivalisがグルタミン酸やアスパルテートを含有するペプチドからbutyrate, propionate, acetateなどのSCFAsを生成するメタボロームパスウェイについて詳細に説明しており、この過程でアミノ酸のデアミナーゼとアミノ転移酵素が作用することを示しています。
関係する細菌（属レベル）
関係する細菌（種レベル）
porphyromonas
porphyromonas gingivalis