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Porphyromonas gingivalisの代謝

Copyright by Skin Flora Academy

Role of gingipains in growth of Porphyromonas gingivalis in the presence of human serum albumin.

PMID

11447200

スタディーの内容

ヒト血清アルブミン存在下でのPorphyromonas gingivalis増殖に対するArg-およびLys-ジンギパインの寄与を、変異株・阻害剤・蛍光標識蛋白で調べた。

アブストの内容

ヒトアルブミンを唯一の炭素・窒素源とする定義培地で、Arg-およびLys-ジンギパインが増殖に重要であると報告。両者不活化で増殖不能、片方不活化で倍加時間は親株の9時間からそれぞれ13時間・33時間に延長。アルブミン断片は菌体に取り込まれ、歯周病部位の歯周ポケット液で低分子アルブミン断片が検出された。阻害剤ではleupeptinがより増殖抑制効果を示したが、主にin vitro条件の知見で臨床意義は慎重に解釈する必要がある。

​選ばれた理由

論文は Gingipains の作用が P. gingivalis の成長に重要な役割を果たしており、これはプロテインの分解とアミノ酸供給に関連しています。

関係する細菌(属レベル)

関係する細菌(種レベル)

porphyromonas

porphyromonas gingivalis

Cleavage of human transferrin by Porphyromonas gingivalis gingipains promotes growth and formation of hydroxyl radicals.

PMID

15271890

スタディーの内容

Porphyromonas gingivalisのジンギパインによるヒトトランスフェリン分解とそれに伴うHO*生成を実験的に解析

アブストの内容

Arg・Lysジンギパインはヒトトランスフェリンを断片化して遊離鉄や低分子鉄断片を生じ、これらを菌体が取り込み増殖に利用した。生成断片や放出鉄はHO*を触媒的に発生させ得る。歯周溝液で断片が検出された点は臨床的関連を示唆するが、組織破壊への直接的寄与はin vivoでの検証が必要。

​選ばれた理由

論文はP. gingivalisの Gingipain cysteine proteinasesが人間の transferrinを分解し、自由基やペプチドを提供することで細菌の成長を促進することを示しています。

関係する細菌(属レベル)

関係する細菌(種レベル)

porphyromonas

porphyromonas gingivalis

Enzymatic Characteristics and Activities of Gingipains from Porphyromonas gingivalis.

PMID

32815131

スタディーの内容

歯周病原菌Porphyromonas gingivalisの主要システインプロテアーゼ(ジンギパイン:Rgp/Kgp)の酵素特性・活性と解析法を明らかにすること。

アブストの内容

ジンギパイン(RgpA/RgpB、Kgp)はP. gingivalisの主要システインプロテアーゼで、歯周組織の分解、宿主防御の破綻、線維芽細胞や内皮細胞の生存低下に関与するとされる。さらに菌のアミノ酸・ヘム獲得や線毛などの蛋白処理を通じ、血球凝集・共集落・ヘモグロビン結合にも寄与する。抽象は主に解析法の記述で、定量的データや実験系の詳細が示されておらず、因果関係や臨床的一般化には注意が必要。

​選ばれた理由

論文のアブストラクトは、ギンピパンがP. gingivalisの成長と生存に重要であることを強調しており、特にアミノ酸の獲得に関連しています。

関係する細菌(属レベル)

関係する細菌(種レベル)

porphyromonas

porphyromonas gingivalis

Polymicrobial synergy stimulates Porphyromonas gingivalis survival and gingipain expression in a multi-species subgingival community.

PMID

34911531

スタディーの内容

血清模倣環境の多種共存モデルで、P. gingivalisの生存・増殖とジンギパイン発現を増殖・プロテアーゼ活性測定や共培養で調べた。

アブストの内容

単独では血清環境で増殖できなかったP. gingivalisは、F. nucleatum・S. constellatus・P. micraを含むコンソーシアムでは血清で増殖しプロテアーゼ優位の表現型を示した。Rgp型ジンギパインを欠く変異株の結果から、Rgpが複合タンパク質を分解してコミュニティへの栄養供給を助け、他菌からのシグナルで血清下のジンギパイン発現が調整される可能性が示された(in vitroモデルによる結果)。

​選ばれた理由

論文の結果は、Rgp gingipainが複数種の口腔微生物群集団内で栄養素を供給することで全体的な成長を促進することを示しています。

関係する細菌(属レベル)

関係する細菌(種レベル)

fusobacterium, parvimonas, porphyromonas, streptococcus

fusobacterium nucleatum, parvimonas micra, porphyromonas gingivalis

Purification and characterization of a collagen-degrading protease from Porphyromonas gingivalis.

PMID

7506259

スタディーの内容

口腔病原菌Porphyromonas gingivalisの培養上清から膠原分解能を持つプロテアーゼを精製し、性質を解析した研究。

アブストの内容

培養上清から精製された約55 kDaのトリプシン様プロテアーゼは、ヒト胎盤のⅠ・Ⅲ・Ⅳ・Ⅴ型やラット・ウシのⅠ型コラーゲンを分解し、補体C3やフィブリノーゲンなど複数の宿主タンパクも切断した。還元剤で活性化され、システインプロテアーゼ阻害剤で抑制されたためシステインプロテアーゼ様と示唆され、歯周組織破壊や侵入に関与する毒性因子になり得ると提案されている。ただしin vivoでの関与や詳細機構は示されていない。

​選ばれた理由

論文の要約は、Porphyromonas gingivalisから分泌されるプロテアーゼがコラーゲンを分解し、その結果、細胞外タンパク質の降解とペプチドやアミノ酸の供給により菌体の成長を支援することを示しています。

関係する細菌(属レベル)

関係する細菌(種レベル)

porphyromonas

porphyromonas gingivalis

Characterization of the binding activities of proteinase-adhesin complexes from Porphyromonas gingivalis.

PMID

8631676

スタディーの内容

Porphyromonas gingivalisのタンパク質分解酵素–アドヘジン複合体がフィブリノーゲン等に結合・分解する性質を阻害剤と結合試験で調べた研究。

アブストの内容

アドヘジン複合体はフィブリノーゲン(結合解離定数:gingipain K=4 nM、gingipain R=8.5 nM)やフィブロネクチン・ラミニンに特異的に結合し、結合後にプロテアーゼドメインでこれらを分解した。gingipain Rはラミニン・フィブロネクチン、gingipain Kはフィブリノーゲンの分解に優れ、複合体は付着→分解→離脱を繰り返す可能性が示唆される。ただし多くは試験管内の解析に基づくため、生体内での役割は直接示されていない。

​選ばれた理由

論文のアブストラクトは、 Gingipain RとGingipain Kがプロテインを分解し、接着性を持つことを示しています。これは仮説に直接一致します。

関係する細菌(属レベル)

関係する細菌(種レベル)

porphyromonas

porphyromonas gingivalis

Albumin and hemalbumin degradation by Porphyromonas gingivalis.

PMID

9467396

スタディーの内容

Porphyromonas gingivalis細胞が牛アルブミンと、異なるヘム結合比のヘムアルブミンを37°C非還元条件で分解する様子を電気泳動と密度測定で調べた。

アブストの内容

P. gingivalisは牛アルブミンとヘム結合アルブミンを分解して耐性の55.6 kDa断片を生じ、N末端ヒンジ領域での切断が示唆された。TLCKやN‑ethylmaleimideが分解を抑え、初期分解速度は似ているが7.5時間での総分解量はヘム比の増加で減少した。in vitro結果からヘム放出を助ける可能性が示唆される。

​選ばれた理由

論文はPorphyromonas gingivalisがアルブミンとヘマブルビンを分解し、特定の部位で消化することでヒメインを放出する能力について述べており、これは Gingipain システインプロテアーゼによる外部タンパク質の分解と、そのペプチドやアミノ酸が細菌の成長を支援することを示唆しています。

関係する細菌(属レベル)

関係する細菌(種レベル)

porphyromonas

porphyromonas gingivalis

Characterization of the proteinase-dependent cytotoxicity of Porphyromonas gingivalis.

PMID

9708689

スタディーの内容

Porphyromonas gingivalisの培養上清中タンパク質が、培養した歯肉線維芽細胞と上皮細胞に与える細胞毒性を各種アッセイと顕微鏡で検討した

アブストの内容

P. gingivalisの培養上清は細胞の丸まりと剥離を主とする傷害を引き起こし、その活性はシステイン依存性プロテアーゼ活性やジンギパインに一致。加熱やシステインプロテアーゼ阻害薬で活性は消失し、細胞間基質の分解が主な毒性機序であると報告する。ただし抽象には濃度や定量データ、細胞由来やin vivo検証は示されていない。

​選ばれた理由

論文の要約は、ギンピパンのリリースされたプロテアーゼが細胞損傷に関与しており、その主な原因は細胞間マトリックスの分解であると示しています。これは仮説を直接支持します。

関係する細菌(属レベル)

関係する細菌(種レベル)

porphyromonas

porphyromonas gingivalis

Porphyromonas gingivalis Gingipains Display Transpeptidation Activity.

PMID

29984580

スタディーの内容

P. gingivalisの表面プロテアーゼ(Kgp, RgpA/B)が、ペプチド受容体の有無でヒトヘモグロビンをどう分解するかを、精製酵素・細胞と質量解析で調べた

アブストの内容

KgpやRgpA/Bはグリシルグリシン(GlyGly)存在下でトランスペプチド化を示し、GlyGly濃度依存で加水分解より優勢になった。精製酵素とP. gingivalis細胞はヒトヘモグロビンで多数(最大116)のトランスペプチド産物を生じ、血清アルブミン由来受容体は分解を促進した。in vivoでの自己免疫への影響は示唆されるが直接証明はされていない。

​選ばれた理由

論文はP. gingivalisのプロテアーゼがホストタンパク質を分解し、その過程でトランスペプチダーザ活動が起こり、免疫応答や炎症に影響を与える可能性について述べています。

関係する細菌(属レベル)

関係する細菌(種レベル)

porphyromonas

porphyromonas gingivalis

Analysis of the protease and adhesin domains of the PrpRI of Porphyromonas gingivalis.

PMID

9085223

スタディーの内容

歯周病原菌Porphyromonas gingivalisのアルギニン特異的プロテアーゼ(PrpRI/ArgIファミリー)の遺伝子、構造、及び結合能を解析した研究。

アブストの内容

遺伝子解析と構造・免疫化学的解析により、ArgI/ArgIA/ArgIBはプロテアーゼ活性と接着(アドヘジン)領域を備えた互いに関連する酵素群で、遺伝子が高く保存されることからPrpRIはP. gingivalisの定着に重要な因子であり、歯周病過程に関与する可能性が示唆された。ただし、病態への直接的な因果関係は示されていない。

​選ばれた理由

論文のアブストラクトは、P. gingivalisのプロテアーゼが宿主タンパク質を分解し、炎症や組織の持続性制御に影響を与える可能性について述べています。

関係する細菌(属レベル)

関係する細菌(種レベル)

porphyromonas

porphyromonas gingivalis

Albumin and hemalbumin degradation by Porphyromonas gingivalis.

PMID

9467396

スタディーの内容

Porphyromonas gingivalis細胞が牛アルブミンと、異なるヘム結合比のヘムアルブミンを37°C非還元条件で分解する様子を電気泳動と密度測定で調べた。

アブストの内容

P. gingivalisは牛アルブミンとヘム結合アルブミンを分解して耐性の55.6 kDa断片を生じ、N末端ヒンジ領域での切断が示唆された。TLCKやN‑ethylmaleimideが分解を抑え、初期分解速度は似ているが7.5時間での総分解量はヘム比の増加で減少した。in vitro結果からヘム放出を助ける可能性が示唆される。

​選ばれた理由

論文はP. gingivalisがアルブミンとヘマブルビンを分解し、55.6-kDaペプチド生成について詳細に説明しており、これはプロテアーゼ活性によるホストタンパク質の分解産物として免疫応答や炎症を制御する可能性を示唆しています。

関係する細菌(属レベル)

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porphyromonas

porphyromonas gingivalis

Cytokine degradation by biofilms of Porphyromonas gingivalis.

PMID

9504988

スタディーの内容

P. gingivalisバイオフィルムがIL-1β・IL-6・IL-1raを試験管内で膜上培養とウエスタンブロットで検証

アブストの内容

バイオフィルム状態のP. gingivalisは、添加したIL‑1β・IL‑6・IL‑1raをプロテアーゼ的に分解し、2時間で元のサイトカインは検出されなかった。馬血清存在下でも分解が起き、局所のサイトカイン環境を変え得ることが示唆されるが、in vitro結果であり体内での影響や分解酵素は未同定である。

​選ばれた理由

論文のアブストラクトは、プロテオジー活性により細胞因子が分解されることを示しており、これは宿主免疫応答と炎症に影響を与える可能性があるという仮説を支持しています。

関係する細菌(属レベル)

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porphyromonas

porphyromonas gingivalis

 

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